Ngoài những nguyên nhân khách quan thì những nguyên nhân thuộc về chủ quan thường được quy về ba vấn đề nổi cộm:

Một là, thủ tục đầu tư còn nhiều vướng mắc, rườm rà. Thường thì quy trình từ khi dự án được cấp có thẩm quyền phê duyệt kế hoạch đầu tư đến khi công trình được triển khai thi công phải mất từ hai đến ba tháng đối với các công trình được phép chỉ định thầu và từ bốn đến năm tháng đối với các công trình yêu cầu phải đấu thầu rộng rãi.

Hai là, vướng mắc trong đền bù, giải phóng mặt bằng (GPMB). Mặc dù thời gian qua, nhiều nơi đã thực hiện những giải pháp phân cấp, ủy quyền phê duyệt phương án đền bù, GPMB nhưng cho đến nay vẫn chưa được thực hiện có hiệu quả. Do trên thực tế, thời điểm ban hành quyết định thu hồi và thời điểm bồi thường, GPMB là khác nhau và giá trị đất tại hai thời điểm này là chênh lệch tương đối lớn, làm cho người được đền bù không chấp nhận dẫn tới tiến độ bồi thường, GPMB kéo dài, ảnh hưởng tiến độ đầu tư.

Ba là, về năng lực quản lý, tài chính, tổ chức thực hiện và vận hành dự án của các cơ quan quản lý, các đơn vị tư vấn, đơn vị xây dựng còn không ít hạn chế; một số chủ dự án chưa thể hiện hết vai trò và trách nhiệm đối với dự án...

Nhằm tạo điều kiện đẩy nhanh giải ngân vốn đầu tư XDCB sử dụng vốn Nhà nước năm 2009 và các năm tiếp theo, góp phần thực hiện tốt các giải pháp kích cầu đầu tư (trong đó có gói kích cầu đầu tư xây dựng), ngăn ngừa suy giảm kinh tế của Chính phủ, các vướng mắc nêu trên cần sớm được tập trung giải quyết, tháo gỡ. Trong công tác GPMB, để có thể tiến hành nhanh các bước, về nguyên tắc, đòi hỏi phải giải quyết cơ bản chung quanh vấn đề giá trị đền bù đất giải tỏa một cách khoa học, hợp lý và nhất quán. Mặt khác, các phương án đền bù phải bảo đảm công khai, minh bạch, dân chủ; các chủ đầu tư cần phối hợp chặt chẽ hơn với các ngành, các cấp liên quan. Các địa phương cần chủ động làm tốt việc xây dựng và triển khai trước một bước các dự án di dời, sắp xếp tái định cư đối với các dự án trên địa bàn. Các cơ quan liên quan giải ngân, quyết toán cần đẩy mạnh cải cách hành chính. Rà soát lại quy trình và thời gian thực hiện sao cho nhanh gọn. Cơ quan tài chính cần khẩn trương thực hiện cơ chế thanh toán mới ban hành để kịp thời giải ngân khi nhà thầu có khối lượng thanh toán. Các chủ đầu tư cần tập trung chỉ đạo đẩy mạnh tiến độ thực hiện dự án. Khi ký hợp đồng với nhà thầu, cần có điều khoản xử phạt giá trị vi phạm do thi công chậm và kém chất lượng. Ðối với những vấn đề liên quan trình tự, thủ tục đầu tư, cần sớm khơi thông theo hướng đơn giản hóa... Trong phiên họp mới đây của Ủy ban Thường vụ Quốc hội thảo luận về phương án sửa đổi, bổ sung một số điều của các luật liên quan đầu tư XDCB, những vướng mắc, bức xúc nhất đều liên quan đến trình tự, thủ tục giai đoạn chuẩn bị đầu tư trong XDCB. Nếu những vướng mắc sớm được tháo gỡ chắc chắn đầu tư xây dựng cơ bản sẽ được thúc đẩy đạt hiệu quả cao hơn.